Sklep internetowy megaSklepy został zoptymalizowany pod kątem wyszukiwarek internetowych. Dzięki temu poszczególne strony sklepu są łatwiej indeksowane przez wyszukiwarki, a co za tym idzie stają się łatwiej odnajdywalne przez potencjalnych Klientów. Oprogramowanie posiada funkcję samodzielnego definiowania tytułu, słów kluczowych oraz opisu dla każdej ze stron sklepu. Dzięki tej funkcjonalności możemy jeszcze bardziej wpłynąć na pozycję stron sklepu w wyszukiwarkach internetowych.